Программы.

Програмные телефоны (UA):

XLite - беплатная программа с ограниченным количеством поддерживаемы кодеков.

АТС:
Asterisk PBX (для *nix) asterisk

Биллинг:
UTM Tray - утилита для оперативного информирования о состоянии счета. Подробнее о ее настройке можно прочитать в FAQ